腸道菌叢也講究生態平衡。〝好的乳酸菌比例高，等於體質比較優良，對抗疾病的本錢比較雄厚〞，這個理論在國內將尋求進一步的佐證。中國醫藥大學附設醫院中西合作醫療中心正展開一項臨床試驗，首波鎖定過敏性鼻炎，醫師將透過患者糞便檢體的檢查，確認腸道菌叢的優劣，進而幫助患者提高免疫力，改善過敏體質。
中西合作醫療中心主治醫師指出，人體腸胃道中的菌叢有好有壞，好的菌叢具有保護人體的作用，壞的菌叢卻會導致疾病發生。其中乳酸菌有助於抑制致病菌的繁殖，同時可以幫忙人體分泌更多的干擾素，增加抵抗力。最重要的，乳酸菌能有效調節免疫反應，降低過敏症狀的發生。
全球都在進行乳酸菌與疾病關係的研究，去年日本發表異位性皮膚炎患者糞便研究的結果，發現患者腸道中的比菲德氏菌叢數量，明顯低於正常人，而且隨著比菲德氏菌比例的下降，症狀有明顯加重的趨勢。另外，歐洲學者讓孕婦和新生兒食用乳酸桿菌LGG，證實確有預防過敏性疾病的效果。過去該院曾以優酪乳輔助治療過敏性鼻炎，也得到類似結論。近年來機能性優酪乳爭相上市，「體內環保」蔚為風潮，多少都與陸續出爐的研究成果有關。
由於過敏疾病的誘發因素很多，外在環境因素又很難控制，因此改善體質、提高免疫力，成為減少過敏的重要方法。大致說來，體內環保做得好不好，已成為探討問題的一大方向，從腸道菌叢生態的平衡與否，可以判斷出體內環保的成績如何，因此患者糞便檢體的情況成為關鍵。
