中醫治療針眼從清熱著手。台灣中醫臨床醫學會理事羅明宇表示，臨床上，脾胃伏火、熱毒上攻者，治療應以瀉火解毒，清解脾胃伏熱為主；肝脾濕熱蘊滯者，應以清熱利濕，解毒散邪為原則；而脾胃虛弱者，則著重健脾和血，育肝消滯；同時應注意與散結化痰藥結合運用，幫助療效。
中醫師羅明宇表示，針眼中醫辨證治療上，「肝脾伏熱型」者症狀可見針眼反覆發作，胞瞼局部紅腫微紫，灼熱疼痛，按之硬結，伴有面赤口渴，口臭便秘，舌質紅，苔黃厚，脈滑數。治法可採取清解肝脾伏熱原則，處方可用瀉黃散（防風、藿香、石膏、甘草、山梔子）加減。
「肝脾濕熱型」者，狀可見針眼此起彼復，胞瞼局部漫腫，灼熱疼痛，按之硬結或有膿點，分泌物多，臉胞浮腫，赤爛滲水。伴有胸悶院痞，口乾而黏，大便稀軟排便不快。舌質紅、體胖，苔黃膩，脈濡數。治法可採清利肝脾濕熱原則，處方可用甘露消毒飲（滑石、茵陳、黃芩、菖蒲、木通、川貝母、連翹、射干、薄荷、白蔻仁、藿香）合龍膽瀉肝湯（龍膽草、車前子、黃芩、澤瀉、木通、生地、當歸、梔子、甘草、柴胡）加減。
以及「脾胃虛弱型」者，症狀可見胞起針眼，經久不愈，胞瞼紅腫疼痛不甚，伴面色白體倦、納呆腹脹，乏力神疲。舌質淡、苔薄白、脈沉細。治法可採疏肝健脾、化痰散結原則，處方可用六君子湯（人參、白朮、茯苓、甘草、生薑、半夏、陳皮、砂仁、木香）加味。
中醫師李思儀表示，大多數的針眼多屬於「血熱」狀況，稍加清熱涼血中藥，便能改善紅腫疼痛。但也有少數的病人，是屬於反覆感染針眼，或者病程往往拖很久，一兩星期不愈，這時治療的方向就不能只強調清熱涼血，要適時加些補氣藥如黃耆、黨參，幫助托里化癰腫；因為氣不足反而容易反覆感染。
一旦感染卻又病久不癒，這時也不能一味吃綠豆、西瓜清涼的食物，如此反不利病況的恢復。因此，醫師強調，同樣的疾病在不同人的身上，依證用藥是很重要的。
