政府核心人士表示，高鐵財務流動不足，將在年底引爆危機，但最近高鐵與銀行團的協商並不順利，銀行團仍要求高鐵大股東先行增資，銀行團確保債權後，才有意願借新還舊。至於利率，高鐵向政府反映盼爭取降至2％以下。
高鐵財務重整計畫，政院在5、6月間已召開多次專案小組會議，決定採借新還舊方式，為高鐵財務資金缺口解決困境，相關官員說，若高鐵財務重整計畫不成功，最後很難避免走上政府強制接管一途。
據悉，政院指定台銀擔任主辦銀行後，台銀與聯貸銀行團及高鐵協商並不順利，官員說，聯貸銀行要求高鐵大股東應先行增資，至少需1、200億元以上，但高鐵大股東增資意願相當低，高鐵與銀行團協商停留原地，沒有太大進展。
台銀負責主導的借新還舊的財務重整計畫共計3,900億元，但政府保證只有第一聯貸案的3,083億元，超過部分高鐵用其他設定抵押，政府不再出資，整個財務重整，朝協調聯貸銀行降低利率方向著手，聯貸銀行希望債權確保，才有增貸意願。
第一聯貸案3,083億元，利率目前為2.7％，第二聯貸案655億元，沒有政府保證，利率可能高達3.8％，還有高鐵約有125億元ECB（海外可轉換公司債），總計額度近3,900億元。
相關首長曾在政院內部會議表示，101大樓背後抵押品再融資利率才1.7％，高鐵希望借新還舊財務重整案利率降至2％以下或2％左右，此有待與銀行團再協商。
高鐵公司資本額1,053 億元，累積虧損已達702億元，目前聯貸案利息負擔沈重，這半年內一定要與銀行團談成，否則高鐵撐不下去。
台灣高鐵目前仍面臨融資重組、折舊年限合理化、落實協調委員會機制，以及2012年新會計公報適用時的資產認定等影響營運績效的重大問題，交通部也已研議民間參與交通建設接管營運辦法草案，政府接管主係不使運輸服務中斷。
